如何在Windows电脑上使用LDSC软件（1）---Linux子系统安装

LDSC （LD Score Regression）是基于LD评分的回归分析，主要用于计算表型的可遗传度（heritability）和表型间的遗传关联度（genetic correlation），是群体遗传学常用的分析软件，目前在Github上已收获386颗星，其影响力可见一般（https://github.com/bulik/ldsc）。

最近米老鼠正在Windows系统上使用这个工具，中间经历了太多的坑，现在整理一下和大家分享。

虽然这个Python工具的功能很强大，但它是基于Python 2.7编写的，因此对一些依赖包有特定的版本要求，具体如下：

这里有个包pybedtoools 0.7，它是没有Windows版本的，因此想单纯在Windows系统上使用LDSC是完全不可能，这时候注定必须依赖Linux系统来完成LDSC，所以基本上只有两个选择：（1）安装虚拟机，在虚拟机上装Linux系统；（2）安装Windows的Linux子系统（WSL）。考虑到WSL使用简单并且占用的物理内存较少，故米老鼠开始在自己的Windows上安装WSL了。

首先声明一下，米老鼠现在使用的是Windows11操作系统，以下操作均是基于该系统完成的，如果是其它Windows版本的小伙伴们需要注意一下。

首先需要咱们在搜索框里输入并打开“启用或关闭Windows功能”这一功能，然后勾选“适用于Linux的Windows子系统”和“虚拟机平台”这两个选项，如下图所示：

然后点击“确定”，这时候电脑会开始进行配置，配置完成后重启电脑即生效。

然后“Win + R”打开“运行”，在里面输入“cmd”，如下图所示：

点击“确定”后即可进入Windows的命令提示符界面，接下来咱们使用命令行安装Linux子系统：

wsl --list --online

如上图所示，有Ubuntu，Debian，kali，openSUSE和SLES这五个可选，其中Ubuntu也有三个不同版本可选

接下来咱们输入如下指令：

wsl --install

该指令会默认下载并安装Ubuntu子系统。

如果想下载其他版本的话，可以使用如下指令：

wsl --install -d <DistributionName>

把<DistributionName>替换成特定的Linux系统的NAME即可。

具体的安装信息请查阅官网文档 （https://docs.microsoft.com/en-us/windows/wsl/install）

安装完成后，我们在检索框输入“Ubuntu”后就会出现Ubuntu的小图标，点击后打开即可，初次进入的用户需要设置用户名和密码。

最终的页面如下图所示：

关于Linux子系统的安装就完成了，是不是感觉比安装虚拟机简单很多呢？这是咱们使用LDSC的第一步，在下一期内容中米老鼠会带大家配置LDSC的 使用环境（坑实在太多了。。。。），敬请期待！！！